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Cómo arreglar un archivo nii o rec con volumen parcial

Cómo arreglar un archivo nii o rec con volumen parcial


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El problema que tengo es que la resonancia magnética se detiene manualmente, antes de que se complete la tarjeta del examen. Por lo tanto, los programas de análisis de datos leen el encabezado y esperan una cierta cantidad de volúmenes, pero tiene menos, y además el volumen final es parcial, por lo que no puedo simplemente modificar el encabezado para que busque menos. Los programas como fslroi que permiten recortar volúmenes no manejan volúmenes parciales. ¿Cómo puedo eliminar los datos parciales para que el archivo se lea correctamente?


Encontré la solución usando el paquete de python nibabel. El código es bastante simple. Sinombre del archivoes su uso de archivo nii o rec:

importar nibabel como nib img = nib.load (nombre de archivo, permit_truncated = True) print ("Guardando imagen con forma:", img.shape) nib.save (img, "truncated_ {0}". formato (nombre de archivo))